简介序第一章·伤寒要义第二章·六经方药第三章·表里寒热第四章·气血虚实第五章·伤寒诊法第六章·伤寒脉舌第七章·伤寒本证第八章·伤寒兼证第九章·伤寒夹证第十章·伤寒坏证第十一章·伤寒复证第十二章·调理诸
痎疟论疏
序一序二序三自序卷一草部黄甘草人参北沙参丹参元参白术苍术葳蕤黄精狗脊石斛远志石菖蒲牛膝甘菊花五味子天门冬麦门冬款冬花紫菀旋复花百部桔梗马兜铃白前白芨半夏天南星贝母栝蒌实天花粉夏枯草昆布独活羌活防风本葛
进表卷一治诸风（附香港脚）至宝丹灵宝丹润体丸乌犀丸牛黄清心丸摩挲丸透冰丹龙脑天麻煎牛黄小乌犀丸娄金丸龙虎丹麝香天麻丸龙脑芎犀丸银液丹和太师牛黄丸碧霞丹雄朱丸八风丹牛黄生犀丸辰砂天麻丸青州白丸子辰砂丸牛
叙卷一肿疡（谓疮疡未出脓者）溃疡(谓疮疡已出脓者)溃疡作痛卷二溃疡发热(附恶寒)发背脑疽卷三鬓疽时毒(谓毒发于面鼻耳项)疔疮臀痈(附腿痈并腿痛香港脚)卷四脱疽肺痈肺痿肠痈卷五瘰流注疮疡作渴作呕卷六咽喉
养性延命录
自叙卷一·温病解第一温病名义附岐伯温义附仲景温义温病根原病原同异风寒异邪营卫殊伤传经大凡太阳经证头痛热渴阳明经证目痛鼻干少阳经证胁痛耳聋三阳传胃太阴经证腹满嗌干少阴经证干燥发渴厥阴经证烦满囊缩三阴入脏
一瓢医案
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记