简介自序凡例卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十卷之十一卷之十二卷之十三卷之十四
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
吴序张序自序张声驰序卷上人身一小天地论阴阳互根论五行生克论阴阳治法大要论枢机论卫气行度一经星经天论营气行度一经水行地论百病提纲论望病须察神气论卷中闻声须察阴阳论问证求病论切脉源流论内伤大要论湿气论卷下
序自叙卷一朝廷对于医者之医方卷二世界对于医者之医方卷三医者自医之医方
王序卷一四明心法（上）诊法脉义二十五方总图二十五方分图二十五方图解二十五方主症卷二四明心法（中）方论药论卷三四明心法（下）中风伤寒疟疾痢疾鼓症膈症吞酸眩晕咳嗽怔忡血症弱症消症霍乱胃脘痛胎前产后带下淋症
本草图经序本草图经奏敕玉石上品卷第一玉屑玉泉（图缺），文具玉屑条下。丹砂空青曾青（图缺），文附空青条下。绿青扁青，文具绿青条下。石胆云母石钟乳殷孽，文具石钟乳条下。孔公孽，文具石钟乳条下。石花，文具石
人体解剖学歌诀内容运动系统运动系统歌诀全身骨歌诀各部椎骨特点歌诀胸骨歌诀颅骨歌诀鼻旁窦歌诀脊柱的韧带歌诀脊柱形态歌诀胸廓歌诀肩关节歌诀肘关节歌诀手腕骨歌诀膝关节歌诀跗骨歌诀颅底内面歌诀新生儿颅骨歌诀膈
序卷一十二官六脏六腑纳甲诗内景说心说肝说脾说肺说肾说胃说胆说大肠小肠说三焦说手心主说(即心包络)膀胱说命门说附录高士宗部位说经络易知十二经脉起止图十六络穴图经络说十二经诗十六络诗十二经气血流注诗（旧本
卷一九针十二原第一（法天）本输第二（法地）小针解第三（法人）邪气脏腑病形第四（法时）卷二根结第五（法音）寿夭刚柔第六（法律）官针第七（法星）本神第八（法风）终始第九（法野）卷三经脉第十经别第十一经水第
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