卷上卷下
序祭神应王文岐伯阴阳脉例洁古老人内伤三阴例海藏老人内伤三阴例伤在少阴伤在太阳阴阳寒热各从类生服药同象伊芳尹汤液论例扁鹊仲景例仲景阴证论例易老法霍乱吐泻足阳明总摄六经霍乱与少阴寒热同候叔和阴脉例活人阴脉
卷上四时正脉春夏秋冬中真脉厥阴所胜生病运气所胜司天所胜在泉所胜少阴所胜生病运胜天胜地胜太阴所胜生病运胜天胜地胜阳明所胜生病运胜天胜地胜太阳所胜生病运胜天胜地胜少阳所胜生病天胜地胜六气复而生病厥阴之复少
前言辅行诀脏腑用药法要一 辨肝脏病证文并方二 辨心脏病证文并方三 辨脾脏病证文并方四 辨肺脏病证候文并方五 辨肾脏病证文并方六 五脏泻方七 救五脏诸劳损病方八 二旦六神大小汤九 救五脏中恶卒死方附录
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
序序卷一太阳篇卷二阳明篇卷三少阳篇卷四太阴篇卷五少阴篇卷六厥阴篇
序卷上辩血辩气辩两肾辩三焦辩包络辩督脉辩脏腑阴阳辩九窍辩七门春伤于风夏生飧泄，秋伤于湿冬生咳嗽冬伤于寒春必病温，夏伤于暑秋必疟亢则害承乃制制则生化上部有脉下部无脉，其人当吐不吐者死东方实西方虚，泻南方
卷一目睛原始歌五轮所属部位歌五轮主五脏病歌八廓部位歌八廓所属歌八廓主六腑命门包络病歌内因为病歌外因为病歌不内外因为病歌内障总名歌内障初患久变五风歌五风初患有余歌五风初患不足歌黄风有余歌黄风不足歌绿风有
卷上春温时疠湿温暑燥病寒病冬温疟疾卷下女科幼科痘科痧疹外科
正文太虚理气天地阴阳歌五行质气生克制化歌运气合脏腑十二经络歌主运歌主气歌客运歌客气司天在泉间气歌运气分主节令歌五音主客太少相生歌五运齐化兼化六气正化对化歌六十年运气上下相临歌起主客定位指掌歌天符太乙天