序卷之一脉经序学诊例总论脉式三部分位六经所属五脏所属五脏本脉体六经本脉体五脏传变病脉六经中伤病脉五用乖违病脉脉偶名状七表病脉八里病脉九道病脉卷之二太医习业五科凡例纪用备论脏腑配天地论三因论外所因论叙中
前言卷第一摄生之一（佚）卷第二摄生之二（卷末缺）顺养六气九气调食寿限卷第三阴阳阴阳大论调阴阳阴阳杂说卷第四（佚）卷第五（卷首缺）人合阴阳合四海合十二水卷第六（卷首缺）脏腑之一五脏命分脏腑应候脏腑气液卷
金匮要略金匮要略方论序卷上 藏府经络先后病脉证第一卷上 痉湿喝病脉证第二卷上 百合狐惑阴阳毒病证治第三卷上 疟病脉证并治第四卷上 中风历节病脉证并治第五卷上 血痹虚劳病脉证并治第六卷上 肺痿肺痈咳嗽上
序序凡例卷一述原引种预防禁忌辨证卷二论治（上）卷三论治（下）卷四运气选案
一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
跋白缠喉叙自叙《续重楼玉钥》自叙序总论喉痹大意论喉痹关乎运气而有火湿寒之异统论脾胃皆交于口而脾为之主统论唇为脾胃肝之所主统论舌为心脾所主论齿为肾胃大肠所属诸证补遗附录选方咽喉虚实总辨各证分辨附录医案喉
内外伤辨惑论
叙四诊初生门惊风门痫证门疳证门呕吐门泻证门感冒风寒门瘟疫门暑证门霍乱门痢疾门疟疾门咳嗽门喘证门痰证门疝证门淋证门头痛门腹痛门黄胆门水肿门腹胀门发热门癖疾门汗证门失血门杂证门幼科证治汇方
自序痰总论痰鉴别法外治法门内治法门禁用须知宜食物品痰医案附 杨梅验方附 喉蛾捷诀
导言五菜药解韭菜葱薤（蒜苗）葵藿五谷药解粳米小麦大豆黍米(又称糯小米、黄米)芝麻(又名胡麻、脂麻)五果药解杏李桃栗枣五畜药解猪肉牛肉羊肉鸡肉狗肉