序一序二序三序四序五述古八则麻疯二十一论麻疯三十六种辨症图说五不治（轻亦可治）五主治内治九法外治六法疯门总论疯门总药正治诸方变治诸方攻下诸方外治诸方点痣法瘰烂法雷火针法千金方
序凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十附录附录
陈序童序自序增补本草备要自序本草备要凡例药性总义内容草部黄甘草人参沙参丹参元参白术苍术葳蕤黄精狗脊石斛远志石菖蒲牛膝甘菊花五味子天门冬麦门冬款冬花紫菀旋复花百部桔梗荠马兜铃白前白芨半夏天南星贝母栝楼仁
医方·（一）治阴虚劳热方1．资生汤2．十全育真汤3．醴泉饮4．一味薯蓣饮5．参麦汤6．珠玉二宝粥7．沃雪汤8．水晶桃9．既济汤10．来复汤11．镇摄汤医方·（二）治阳虚方敦复汤附∶服硫黄法医方·（三）
尚论篇
佛点头脉诀
序序卷一太阳篇卷二阳明篇卷三少阳篇卷四太阴篇卷五少阴篇卷六厥阴篇
脉诀指掌病式图说
第1部分第2部分第3部分第4部分
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固