卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
序一序二序三序四序五序六序七内经要旨序跋凡例助梓缙绅诸公氏号卷之一 历世圣贤名医姓氏五帝三代秦汉魏吴蜀晋南北朝隋唐五代宋金元皇明采摭诸书卷之二 内经要旨（上）唐太仆令启玄子王冰序校上内经素问表阴阳
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
自叙卷一草部苍术黄精益智仁草豆蔻缩砂仁补骨脂肉豆蔻胡芦巴白豆蔻红豆蔻大茴香香附荜拨藿香香薷荜澄茄使君子威灵仙白附子慈菰牵牛子何首乌肉苁蓉锁阳丹参泽兰益母草刘寄奴延胡索胭脂（艹/閶）茹姜黄地榆三七蒲黄续
辨症汇编
第1部分第2部分第3部分
脉诀考证
尚论篇
序卷上辨阴证阳证辨脉辨寒热辨外感八风之邪辨手心手背辨口鼻辨气少气盛辨头痛辨筋骨四肢辨外伤不恶食辨渴与不渴辨劳役受病表虚不作表实治之辨证与中热颇相似卷中饮食劳倦论补中益气汤立方本指朱砂安神丸四时用药加减
卷一月经门诸论经病门诸论崩漏门诸论带下门诸论女科杂症门热入血室血分水分炙脔梅核瘕癖乳症前阴诸症？？足跟疮肿疮血风疮梦与鬼交卷二嗣育门绪论受胎总论胎前杂症门恶阻子烦妊娠烦躁口干子悬子满子肿子气妊娠腹痛胎